生態(tài)環(huán)境監(jiān)測是一項(xiàng)內(nèi)容多、 過程繁瑣、涉及專業(yè)廣的工作，再加上時(shí)間跨度通常較長，因而生態(tài)環(huán)境監(jiān)測工作存在一定的開展難度。為保障工作的順利開展，通常需要按照--定的監(jiān)測流程來進(jìn)行。生態(tài)環(huán)境監(jiān)測是建立在安全、全面、準(zhǔn)確的資料基礎(chǔ)_上的，因此收集材料是開展生態(tài)環(huán)境監(jiān)測的關(guān)鍵性一步。生態(tài)環(huán)境污染會隨著時(shí)間、氣象、季節(jié)及地形等的變化而變化，因此需要對現(xiàn)場進(jìn)行動(dòng)態(tài)的實(shí)地調(diào)查，從而獲取客觀、真實(shí)的資料。調(diào)查的主要內(nèi)容為特定區(qū)域內(nèi)的污染源、自然環(huán)境特征及污染程度等，而調(diào)查、收集資料的方法相對較多，可利用GRS技術(shù)、GIS技術(shù)及RS技術(shù)。此外，不同的領(lǐng)域有不同的也有不同的調(diào)查方法，如海洋污染問題，可利用傳感器、生物芯片、生物免疫法等方式收集數(shù)據(jù)。

　　生態(tài)環(huán)境監(jiān)測具有一定的方向性、目的性，而環(huán)境監(jiān)測項(xiàng)目則給監(jiān)測工作提供一個(gè)明確的方面，保障工作的有效性、科學(xué)性。項(xiàng)目的確定方式通常需要結(jié)合現(xiàn)行的生態(tài)環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)及經(jīng)濟(jì)項(xiàng)目發(fā)展需求進(jìn)行判斷。通過判斷該區(qū)域內(nèi)污染源及主要排放物對環(huán)境、項(xiàng)目發(fā)展的影響，根據(jù)判斷結(jié)果將會對環(huán)境、項(xiàng)目發(fā)展帶來不利影響的項(xiàng)目作為監(jiān)測的對象，而監(jiān)測的項(xiàng)目可根據(jù)監(jiān)測對象的特點(diǎn)做出選擇，確保其具有代表性，如可將水文、氣象、污染源及主要排放物等作為監(jiān)測的項(xiàng)目。在選擇生態(tài)環(huán)境監(jiān)測技術(shù)之前，需要根據(jù)已知的相關(guān)信息制定技術(shù)路線、監(jiān)測方案及監(jiān)測方法。監(jiān)測方案的制定建立在經(jīng)濟(jì)項(xiàng)目的發(fā)展需求與國家環(huán)境安全標(biāo)準(zhǔn)的基礎(chǔ)上，監(jiān)測方案的內(nèi)容包括生態(tài)問題、監(jiān)測臺選址、監(jiān)測范圍、監(jiān)測對象、監(jiān)測設(shè)備、生態(tài)系統(tǒng)要素、監(jiān)測方法、監(jiān)測指標(biāo)、監(jiān)測頻度、監(jiān)測周期11項(xiàng)。